基础研究（公共）实验室

位于东三街院区医技楼5楼，拥有单细胞文库构建解码系统、流式细胞分选仪、数字式单分子多重基因表达谱分析系统、核酸质谱分析系统等科研设备，完善分子生物学、细胞生物学、组织形态学等平台建设，与临床科室建立密切合作。现有科研人员23人（博士17人、硕士6人），引进瑞典哥德堡大学关继奎副教授。在研科研项目37项，其中与院内临床科室开展合作6项、院外合作2项。 

斑马鱼模式动物实验室

实验室位于东三街院区医技楼5楼，拥有斑马鱼自动循环养殖系统、斑马鱼显微注射系统、斑马鱼行为学分析仪、斑马鱼心率分析仪、体视荧光显微镜等大型设备。现有科研人员14人，其中博士4人。已建立了20余种儿童疾病斑马鱼模型，获批科研项目11项，其中国家级项目1项，发表论文13篇，其中SCI论文8篇。与北京儿童医院、郑州大学、新乡医学院等单位开展合作。实验室广受社会媒体关注，《河南日报》《大河报》、河南卫视、都市频道等多家媒体进行报道。

生物样本库

位于郑东院区住院部B座负一层，主要包括样本处理区、样本存储区，样本质控区、低温宝藏区等。拥有全自动液体工作站、气相液氮罐、生物安全柜、核酸蛋白测定仪、高压灭菌锅等设备。现有科研人员4人，其中博士1人。与北京儿童医院样本库建立了样本资源共享合作关系，2021年共收集生物样本19107管，出库291管。 

临床流行病研究室

位于郑东院区一楼科研办及东三街院区医技楼6楼，主要为全院提供全方位临床研究方法学技术支持与服务，定期开展培训。现有科研人员5人，其中博士2人。在引进专家王凯娟教授的指导下，积极推进儿童罕见病临床资源数据库建设，构建儿童罕见病专病队列研究。2021年为医院临床科室提供科研培训32次，开展科研服务200余次，培训300余人。